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期刊文章详细信息

我国新分离盖塔病毒的部分基因组分子特征研究    

Partial genome molecular characteristics of Getah virus newly isolated in China

  

文献类型:期刊文章

作  者:陈维欣[1] 王环宇[2] 付士红[2] 李铭华[2] 刘桂芳[3] 姜红月[1] 王力华[2] 王海岩[3] 王志玉[1] 梁国栋[2]

机构地区:[1]山东大学公共卫生学院病毒学研究室,济南250012 [2]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒性脑炎室,北京100052 [3]山东省疾病预防控制中心

出  处:《中华微生物学和免疫学杂志》

基  金:国家科技部重大传染病专项(2003BA12A08-01);艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治重大专项项目(20087ZX10004-010)

年  份:2010

卷  号:30

期  号:5

起止页码:399-404

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2008、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EMBASE、IC、JST、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的 通过分子生物学方法研究我国山东省2008年分离的盖塔病毒(DY0824)基因组分子生物学特征.方法 应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增出结构区基因和3' UTR片段,连接到载体中进行序列测定,然后用Clustal X1.83和MegaAlign软件对测定的核苷酸和推测的氨基酸序列进行比较分析,用Mega4软件绘制系统发生树.结果 DY0824病毒株衣壳蛋白由804个核苷酸组成,编码268个氨基酸,与国内外其他分离株的核苷酸同源性为95.4%~99.9%,氨基酸同源性为97.4%~100%.E2蛋白全长1266个核苷酸,编码422个氨基酸,与其他株的核苷酸同源性为94.8%~99.5%,氨基酸同源性为97.6%~100%.该病毒3' UTR由401个核苷酸组成,存在3个重复序列.结论 山东省新分离盖塔病毒衣壳蛋白和E蛋白基国与该病毒原型分离株相比分别存在7个和10个氨基酸差异位点,病毒3'UTR区域存在多个核苷酸差异位点.

关 键 词:盖塔病毒 衣壳蛋白基因 E2蛋白基因  3’非翻译区  核苷酸序列

分 类 号:Q[生物科学类]

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