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我国新分离盖塔病毒的部分基因组分子特征研究
Partial genome molecular characteristics of Getah virus newly isolated in China
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]山东大学公共卫生学院病毒学研究室,济南250012 [2]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒性脑炎室,北京100052 [3]山东省疾病预防控制中心
基 金:国家科技部重大传染病专项(2003BA12A08-01);艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治重大专项项目(20087ZX10004-010)
年 份:2010
卷 号:30
期 号:5
起止页码:399-404
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2008、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EMBASE、IC、JST、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的 通过分子生物学方法研究我国山东省2008年分离的盖塔病毒(DY0824)基因组分子生物学特征.方法 应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增出结构区基因和3' UTR片段,连接到载体中进行序列测定,然后用Clustal X1.83和MegaAlign软件对测定的核苷酸和推测的氨基酸序列进行比较分析,用Mega4软件绘制系统发生树.结果 DY0824病毒株衣壳蛋白由804个核苷酸组成,编码268个氨基酸,与国内外其他分离株的核苷酸同源性为95.4%~99.9%,氨基酸同源性为97.4%~100%.E2蛋白全长1266个核苷酸,编码422个氨基酸,与其他株的核苷酸同源性为94.8%~99.5%,氨基酸同源性为97.6%~100%.该病毒3' UTR由401个核苷酸组成,存在3个重复序列.结论 山东省新分离盖塔病毒衣壳蛋白和E蛋白基国与该病毒原型分离株相比分别存在7个和10个氨基酸差异位点,病毒3'UTR区域存在多个核苷酸差异位点.
关 键 词:盖塔病毒 衣壳蛋白基因 E2蛋白基因 3’非翻译区 核苷酸序列
分 类 号:Q[生物科学类]
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