文献类型：期刊文章

作　　者：丁德武[1] 丁彦蕊[2] 陆克中[1] 须文波[2] 黄海生[1]

机构地区：[1]池州学院数学与计算机科学系,安徽池州247000 [2]江南大学信息工程学院,江苏无锡214036

出　　处：《计算机与应用化学》

基　　金：国家自然科学基金资助项目(60474030);安徽省教育厅自然科学基金资助项目(KJ2009B233Z;KJ2010B133);池州学院引进硕士研究生资助项目(XYK200809)

年　　份：2010

卷　　号：27

期　　号：5

起止页码：591-596

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2008、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、JST、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：文中研究重建代谢网络及分析其拓扑结构与功能。首先,详细介绍用于重建代谢网络的主要数据类型以及相关数据库。然后,介绍重建和精练代谢网络的方法,及重建苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)代谢网络的工作。用代谢物图表示该网络,共830个节点,1 132条连线。最后,分析网络的拓扑结构特征,借助代谢网络"蝴蝶结"结构的特征对其予以简化,并从网络的小世界效应、节点度分布和关键代谢物3方面分析其巨强连通体。该巨强连通体的平均路径长度为8.63,节点度分布符合幂律分布,表明它是一个典型的小世界和无标度网络。同时,研究结果表明其关键代谢物均具备重要的生物学功能意义。

关 键 词：代谢网络 度分布 蝴蝶结 小世界

分 类 号：TP339] Q5[计算机类]