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利用16S rDNA结合gyrA和gyrB基因对生防芽孢杆菌R31的快速鉴定
Use of 16S rDNA,gyrA and gyrB Gene Sequence to Identify a Biocontrol Bacillus sp. Strain R31
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]珠海市农业科学研究中心,珠海519075 [2]中山大学生命科学学院,广州510275
基 金:广东省科技厅教育部产学研结合项目(2007B090400083);珠海市产学研结合项目(PC20082043);珠海市科技计划项目(PC20081078)
年 份:2010
卷 号:26
期 号:2
起止页码:160-166
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2008、CSCD、CSCD2011_2012、ZR、核心刊
摘 要:克隆16S rDNA、DNA促旋酶A亚基编码基因gyrA和B亚基编码基因gyrB对分离自石斛兰(Dendrobiumsp.)叶片的广谱抗真菌生防芽孢杆菌R31进行鉴定。首先通过生理生化测定和克隆16S rDNA序列,分析显示其属于芽孢杆菌属(Bacillus),但不能准确鉴定到种;然后分别利用克隆的gyrA基因和gyrB基因以及其BLAST分析结果构建系统发育树,最终将该菌株确定为枯草芽孢杆菌(B.subtilis)。结果显示利用16S rDNA与gyrA基因组合可以快速鉴定枯草芽孢杆菌,利用16S rDNA与gyrB基因组合可以快速鉴定枯草芽孢杆菌及其近缘种。
关 键 词:芽孢杆菌 16S RDNA GYRA基因 gyrB基因 鉴定
分 类 号:S482.292] Q78]
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