登录    注册    忘记密码

期刊文章详细信息

湖北省新分离的二株乙型脑炎病毒全基因组序列特征分析    

Molecular characteristics of the full-length genome of two new Japanese encephalitis virus isolated from mosquitoes in Hubei province

  

文献类型:期刊文章

作  者:姜红月[1] 李铭华[2] 杨小兵[3] 李培龙[4] 张静[4] 孟凤霞[5] 郭玉红[5] 梅立志[6] 付士红[2] 贺圆圆[3] 王环宇[2] 王子军[4] 杨维中[4] 王志玉[1] 梁国栋[2]

机构地区:[1]山东大学公共卫生学院病毒学研究室,济南250012 [2]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 [3]湖北省宜昌市疾病预防控制中心 [4]中国疾病预防控制中心疾病控制与应急处理办公室 [5]中国疾病预防控制中心传染病所媒介生物室 [6]湖北省宜昌市秭归县疾病预防控制中心

出  处:《中华预防医学杂志》

基  金:卫生行业科研专项项目三峡大型水利工程建设对传染病流行潜在传播风险性评估研究(200802019);艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治重大专项(2008ZX10004-010)

年  份:2010

卷  号:44

期  号:5

起止页码:438-443

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2008、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的对2008年湖北省新分离的2株乙型脑炎(简称乙脑)病毒进行全基因组序列测定和分析,了解当地乙脑病毒株的分子生物学特性。方法病毒复苏鉴定后,使用覆盖乙脑病毒全基因组的16对特异性引物,RT-PCR法扩增乙脑病毒HBZG08-09株和HBZG08-55株的全基因组片段,直接测序拼接获得全基因组序列。使用ClustalX 1.83、MegAlign、Mega4和Genedoc3.2等生物学软件进行序列比对、核苷酸和氨基酸同源性分析、系统进化分析及氨基酸位点差异分析。结果新分离的2株乙脑病毒基因组全长均为10965个核苷酸,从97位到10392位为开放阅读框,编码3432个氨基酸,2株间的全基因组核苷酸和氨基酸同源性分别是98.2%和99.7%。进一步的基因型研究显示HBZG08-09株和HBZG08-55株均属于基因Ⅰ型乙脑病毒。2株病毒与我国近年来在河南及浙江的乙脑病毒分离株进化关系最近。与目前使用的减毒活疫苗株sA—14—14-2相比较,HBZG08-09株全基因组共存在82个氨基酸差异,HBZG08-55株存在84个氨基酸差异。但影响毒力或抗原的关键氨基酸位点未发生改变。结论新分离的2株乙脑病毒均属于基因Ⅰ型,与疫苗株相比关键氨基酸位点未见变异。

关 键 词:脑炎病毒亚组,日本  基因型 序列分析  种系发生

分 类 号:R51] R3[临床医学类]

参考文献:

正在载入数据...

二级参考文献:

正在载入数据...

耦合文献:

正在载入数据...

引证文献:

正在载入数据...

二级引证文献:

正在载入数据...

同被引文献:

正在载入数据...

版权所有©重庆科技学院 重庆维普资讯有限公司 渝B2-20050021-7
 渝公网安备 50019002500408号 违法和不良信息举报中心