文献类型：期刊文章

作　　者：刘元宁[1] 常亚萍[1] 李誌[2] 张浩[1] 田明尧[3]

机构地区：[1]吉林大学计算机科学与技术学院,长春130012 [2]长春理工大学应用技术学院,长春130022 [3]中国人民解放军军事科学院生物研究所,长春130062

出　　处：《吉林大学学报（工学版）》

基　　金：国家自然科学基金项目(60673099;60873146;60971089)

年　　份：2010

卷　　号：40

期　　号：3

起止页码：776-781

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2008、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD_E2011_2012、EI(收录号：20102312987649)、IC、INSPEC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：针对甲型流感病毒H1N1基因,从RNAi的角度出发,采用多特征融合的方法,进行siRNA预测。对2009年的46株病毒序列的PA片段进行分析,从经过序列分析所获得的众多靶序列中,采用结构分析手段对靶序列进行筛选,获得较易干扰的靶序列及设计出相应的siRNA。2009年爆发的H1N1病毒,序列保守性高,靶序列一致性高,结构保守性高。该方法可以有效选择可能的靶序列,并在此基础上进一步筛选,以获得少量较易干扰的靶序列,该方法为复杂序列siRNA的设计提供了新思路,对siRNA的优化设计有指导意义,有助于利用RNAi进行H1N1治疗的后续研究。

关 键 词：生物信息学 RNAI SIRNA 二级结构  

分 类 号：TP31]