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德州驴心脏脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因的克隆及序列分析
Cloning and Sequence Analysis of Dezhou Donkey Heart Fatty Acid-binding Protein(H-FABP) Gene
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]青岛农业大学动物科技学院,动物生殖发育与基因工程研究所,青岛266109 [2]山东省东营市农业科学研究所,东营257091 [3]山东省烟台市动物疫病预防与控制中心,烟台264003
基 金:山东省自然科学基金(Y2006D02)
年 份:2010
卷 号:37
期 号:3
起止页码:131-136
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2008、CAS、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:本试验对德州驴心脏脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因进行了克隆测序,并与GenBank中11个物种相应基因编码区核苷酸序列、氨基酸序列进行了比对分析,同时通过最小进化法(ME法)、邻接法(NJ法)和非加权组平均法(UPGMA法)对H-FABP基因编码区核苷酸序列进行了物种间分子系统进化树分析。结果表明,德州驴H-FABP基因由4个外显子和3个内含子组成,外显子1、2、3、4大小分别为73、173、1025、7 bp,内含子1、2、3大小分别为3500、1980、1425 bp。CDS序列全长为405 bp,前体氨基酸数为134个;德州驴与马、野猪、人、牛、山羊、牦牛、大鼠、小鼠、红原鸡、绿头鸭、斑马鱼各物种在H-FABP基因编码区核苷酸序列上有较高的保守性,同源性大小分别为96.79%、91.36%、89.14%、88.89%、88.89%、88.64%、84.07%、83.46%、75.80%、74.81%、67.90%;3种方法构建的物种间分子系统进化树基本一致,并且3种分子进化树结果与动物学分类一致,表明H-FABP基因适合于构建不同物种间的系统进化树。
关 键 词:德州驴 H-FABP基因 克隆 序列分析 分子系统进化
分 类 号:S822]
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