期刊文章详细信息
添加有扩增内标的副溶血弧菌PCR检测方法
Detection of Vibrio parahaemolyticus by PCR method with internal amplification control
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]上海交通大学农业与生物学院,陆伯勋食品安全研究中心,中美食品安全联合研究中心,上海200240 [2]马里兰大学食品安全与应用营养学联合研究院(JIFSAN)和营养与食品科学系
基 金:上海市科委项目(09DZ0503300;091422021200;08DZ0504200);国家科技支撑计划世博科技专项(2009BAK43B31)~~
年 份:2010
卷 号:50
期 号:3
起止页码:387-394
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2008、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、PROQUEST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:【目的】发掘副溶血弧菌特异性更强的检测靶点,并人工构建扩增内标,建立可以有效避免假阴性的新PCR检测体系。【方法】利用生物信息学方法,从副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)基因组DNA中发掘特异性很高的序列,并设计相应的特异性引物,人工构建扩增内标,建立PCR检测体系。【结果】本研究发掘得到的序列vp1332特异性很强,经检索,该序列是编码ABC转运子接合蛋白组分的基因片段,根据此序列设计一对特异检测引物(vp1332L/vp1332R),同时,构建了扩增内标,并建立了PCR检测体系。利用该体系对296株副溶血弧菌和33株非副溶血弧菌进行检测,结果显示,所有以副溶血弧菌为模板的PCR反应均可扩增到一条343bp的特异片段,而模板来源于非副溶血弧菌的则只能扩增到一条499bp的扩增内标片段。灵敏度实验表明,该PCR反应体系的检测灵敏度为1.6×102cfu/mL。人工污染实验表明,起始染菌量为1.24cfu/25g样品时经8h增菌,即可检测到副溶血弧菌。实际样品检测结果也证实该方法的有效性。【结论】本研究建立的PCR反应体系能特异地检测副溶血弧菌,并可有效地排除假阴性,提高检测准确率。
关 键 词:副溶血弧菌 PCR检测 扩增内标 假阴性
分 类 号:TE254.7]
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