文献类型：期刊文章

作　　者：李任峰[1] 田香勤[2] 何启盖[3] 胡建和[1] 赵朴[1] 李学斌[1] 王三虎[1]

机构地区：[1]河南科技学院动物科学学院,新乡453003 [2]新乡医学院医学研究中心,新乡453003 [3]华中农业大学动物医学院农业微生物学国家重点实验室动物病原分室,武汉430070

出　　处：《生物信息学》

基　　金：河南省基础与前沿重点研究项目(082300430020);河南科技学院青年创新基金项目(20065053)

年　　份：2010

卷　　号：8

期　　号：1

起止页码：47-51

语　　种：中文

收录情况：ZGKJHX、普通刊

摘　　要：为了深入研究猪胸膜肺炎放线杆菌(Actinobacillus pleuropneumonie,App)转铁结合蛋白基因(Transferrin Binding Proteins,Tbp)的生物学特性,采用生物信息学方法,对GenBank中的5株App的TbpB的核酸及其氨基酸序列进行比对,选取其中的中国湖北分离株(JL03)对其分子结构、理化性质及功能域、蛋白质二级和三级结构等重要参数进行了预测和分析,并在三级结构的基础上进行了同源建模。结果表明,不同APP菌株之间核酸序列相似性较大,而氨基酸序列存在较大差异,二级结构以延伸链和随机卷曲为主要构件,其空间结构与脑膜炎双球菌GNA1870蛋白相似性较高,以此为模板成功构建了三维结构分子模型,为TbpB基因功能的深入研究提供了线索和参考依据。

关 键 词：猪胸膜肺炎放线杆菌 脚B基因  同源建模

分 类 号：Q811.4[生物工程类]