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云南边境禽流感H5N1亚型病毒血凝素基因分子结构特征分析
Molecular characteristics of the hemagglutinin genes of avian influenza virus subtype H5N1 in the boundary region of Yunnan province
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]云南农业大学,昆明650223 [2]云南省动物疫病预防控制中心,昆明650051 [3]云南省热带带动物病毒病重点实验室,昆明650224 [4]成都军区疾病预防控制中心,昆明650032
基 金:空军科技攻关项目(08G034);云南省科技攻关项目(2006NG-24);云南省后备人才基金项目(2005PY01-12)联合资助
年 份:2010
卷 号:26
期 号:2
起止页码:101-106
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2008、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:目的分析2003-2008年云南边境禽流感H5N1亚型病毒血凝素(HA)基因分子结构特征。方法对2003-2008年在云南边境采集境外禽类样品420份,做H5/N1亚型特异性RT-PCR及多重RT-PCR检测,对阳性样品中H5N1病毒HA基因进行RT-PCR扩增,克隆至pMD18-T载体测序,并与国内外已知参考毒株序列进行比对及系统发育分析。结果21份代表性病毒样品HA裂解位点序列存在4种不同排列方式,均具有高致病性禽流感病毒分子结构特征;HA受体结合位点、糖基化位点及表位关键性氨基酸位点存在变异;系统发育分析表明可划分为5个不同进化分枝(1、2.4、2.3.2、2.3.4、7)。结论2003-2008年云南边境外H5N1病毒间具有遗传差异,进化分枝2.3.4毒株为当地流行的优势毒株,不同进化分枝或同一进化分枝不同毒株HA基因存在变异。
关 键 词:禽流感病毒 H5N1亚型 血凝素 分子特征 进化分枝
分 类 号:S855.3]
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