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铜鱼线粒体控制区的序列变异和遗传多样性
MtDNA CONTROL REGION SEQUENCE VARIATION AND GENETIC DIVERSITY OF COREIUS HETERODON(BLEEKER) IN THE UPPER AND MIDDLE SECTIONS OF THE YANGTZE RIVER
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]西南大学生命科学学院,水产科学重庆市市级重点实验室,三峡库区生态环境教育部重点实验室,重庆400715 [2]暨南大学水生生物研究所,广州510632 [3]第三军医大学中心实验室,重庆400038 [4]宁德高等师范专科学院生物系,宁德352100
基 金:重庆市重大科技攻关项目(CSTC;2005AB1009);三峡库区生态环境教育部重点实验室基金资助
年 份:2010
卷 号:34
期 号:1
起止页码:9-19
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2008、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:采用PCR和DNA测序技术研究长江中上游野生铜鱼的遗传多样性和群体遗传学特征,从9个采样点共获得100尾铜鱼,用于分析的线粒体DNA控制区的片段序列为946bp。在100个序列中,共检测出变异位点47个(其中增添/缺失位点8个),单倍型41种。9个地理群体的平均单倍型多样性(Hd)和平均核苷酸多样性(Pi)分别为0.9257±0.0162和0.004178±0.002337,表现出较贫乏的遗传多样性。群体间的分化指数(FST值)、平均基因流(Nm)、分子方差分析(AMOVA)和平均K2-P遗传距离均表明9个铜鱼地理群体间存在广泛的基因交流,未明显发生群体遗传分化。另外,共享单倍型比例较高,约为34%(14/41)。单倍型的UPGMA分子系统树和简约网络图显示单倍型的聚类与地理分群没有相关性。上述结果表明9个铜鱼地理群体属于同一种群。
关 键 词:铜鱼 线粒体控制区 遗传多样性
分 类 号:Q173]
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