文献类型：期刊文章

作　　者：李劲松[1] 高升杰[1] 周铁丽[2] 夏士林[1] 唐小丽[1] 包其郁[1]

机构地区：[1]温州医学院生命科学学院生物系,325000 [2]温州医学院附属第一医院检验科

出　　处：《中华微生物学和免疫学杂志》

基　　金：浙江省自然科学基金资助项目（Y2081093）;浙江省科技计划项目（2008C23074）

年　　份：2009

卷　　号：29

期　　号：12

起止页码：1140-1143

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2008、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EMBASE、IC、JST、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的通过Solexa高通量测序法研究肺炎克雷伯菌的质粒与耐药性的关系。方法菌株为7年临床分离的206株肺炎克雷伯菌。提取所有菌的全部质粒DNA，Solexa高通量测序获得大规模的短序列。SOAP软件对质粒基因进行分析拼接，分析结果与相关数据库进行比对。MAQ软件分析质粒基因组包含的超广谱β-内酰胺酶（ESBL）多样性及单核苷酸多态性（SNP）情况。结果肺炎克雷伯菌质粒基因组中已知的直接与耐药相关的基因就有13种。质粒基因组中存在多个ABC主动外排转运系统。发现4种编码β-内酰胺酶的ORF，其中SHV型ESBLs分布最广。系统分析了206株肺炎克雷伯菌质粒基因组中SHV型ESBLs的SNPs位点，发现存在着大量的非同义替换SNPs位点。结论发现质粒中SHV型ESBLs基因可能受到选择压力，存在着大量的非同义替换SNPs位点。肺炎克雷伯菌质粒存在外排药物耐药方式，从而形成低水平的非特异多重耐药。

关 键 词：肺炎克雷伯菌 质粒基因组  Solexa测序  SHV—ESBL  

分 类 号：R686]