文献类型：期刊文章

作　　者：何伟[1] 张同武[1] 林毅[1]

机构地区：[1]华侨大学生物工程与技术系工业生物技术福建省高校重点实验室,福建泉州362021

出　　处：《生物信息学》

基　　金：国家自然科学基金(40601046);福建省高等学校新世纪优秀人才支持计划资助基金

年　　份：2009

卷　　号：7

期　　号：4

起止页码：320-322

语　　种：中文

收录情况：ZGKJHX、普通刊

摘　　要：通过同源建模得到了抗癌晶体蛋白Parasporin-4的初始三维结构,利用分子动力学的方法对初始三维结构进行优化,同时分析了模建分子的结构,最后利用Ramachandran plot,结构匹配等方法对模型进行评价。结果显示得到的Parasporin-4结构是具有三个结构域,蛋白模型分子中的键长、键角以及二面角的分布合理,与模版蛋白的主链α碳原子的均方根差RMSD值为0.547 742,在合理范围之内,表明Parasporin-4蛋白模型良好。研究结果为抗癌晶体蛋白的抗癌的分子机制及其定向改造提供了结构信息。

关 键 词：抗癌晶体蛋白 空间结构 同源建模 分子动力学模拟

分 类 号：Q939.124] Q518.3