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2007-2008年北京地区CA16VP1区系统进化分析
Phylogenetic analysis based on VP1 gene of coxsackievirus A16 strains isolated in Beijing from 2007 to 2008
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]首都医科大学基础医学院微生物学教研室,北京100069 [2]首都医科大学附属北京儿童医院皮肤科,北京100045 [3]第三军医大学基础医学部组织胚胎学教研室,重庆市神经科学研究所,重庆400038
基 金:北京市自然科学基金(7072009);北京市属高等学校人才强教计划(2006)~~
年 份:2009
卷 号:31
期 号:23
起止页码:2342-2346
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2008、CAB、CAS、CSA、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的了解2007-2008年北京地区柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CA16)流行情况及其种系进化规律和基因分型。方法收集北京地区2007-2008年133例手足口病病例临床标本,从中筛选CA16毒株,扩增部分毒株VP1区并进行序列测定和分析。结果共筛选得到39例45份CA16阳性标本,测定其中16株病毒的VP1区核苷酸序列,其同源性为91.43%~98.65%,氨基酸同源性为97.98%~100%。该16株病毒与GenBank中选取的24株CA16参考株的核苷酸同源性为78.13%~98.65%,氨基酸同源性为89.9%~100%。16株北京分离株中的9株与近年多数中国大陆分离株形成进化树上亲缘关系较近的一群,其余7株与我国台湾及周边国家的一系列分离株亲缘关系较近。结论CA16为北京地区手足口病的主要致病原之一,本地区毒株同源性较高,同GenBank中24株CA16参比毒株序列进行系统进化分析显示其属于B基因群,16株北京分离株在系统进化树上有分别归属于两支的趋势。
关 键 词:柯萨奇病毒A组16型 手足口病 系统进化分析
分 类 号:R181.34] R373.23[公共卫生与预防医学类]
参考文献:
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引证文献:
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