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紫花苜蓿蛋白质二硫键异构酶mPDI的生物信息学分析与同源建模
Bioinformatics Analysis and Homology Modeling Study of Protein Disulfide Isomerase (mPDI) from Medicago sativa L.
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]曲靖师范学院生物资源与环境科学学院,云南曲靖655011
基 金:曲靖师范学院校内青年科研基金项目(2008QN031)
年 份:2009
卷 号:37
期 号:33
起止页码:16263-16267
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2008、CAS、JST、RCCSE、核心刊
摘 要:紫花苜蓿蛋白质二硫键异构酶的基因已经被克隆测序。利用其mRNA及氨基酸序列,应用生物信息学软件预测了该蛋白质的理化性质、亲/疏水性、信号肽、二级结构、卷曲螺旋结构、跨膜区域、糖基化位点、活性位点、亚细胞定位、功能结构域及高级结构。结果表明,该蛋白质是一个整体疏水性蛋白,细胞定位为粗面内质网,含有512个氨基酸,理论等电点为4.98,信号肽位于1~24号氨基酸;二级结构中α-螺旋占26.37%(135AA),无规则卷曲占53.32%(273AA),延伸链占20.31%(104AA);包含3个卷曲螺旋结构,3个糖基化位点,2个硫氧还蛋白结构域,2个硫氧还蛋白活性位点。Ramachandram结构检测表明此模型的三维结构符合立体化学能量规则。
关 键 词:紫花苜蓿 蛋白质二硫键异构酶 同源建模
分 类 号:S188]
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