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期刊文章详细信息

鸽圆环病毒浙江株全基因组的克隆及序列分析    

Cloning and Analysis of the Complete Genomes of Pigeon Circovirus from Zhejiang Province

  

文献类型:期刊文章

作  者:余旭平[1] 竺春[1,2] 郑新添[1,3] 母安雄[4] 于洪涛[1]

机构地区:[1]浙江大学动物科学学院农业部动物疫病病原学与免疫控制重点实验室,杭州310029 [2]宁波市北仑区畜牧兽医总站,北仑315800 [3]龙岩学院生命科学学院,龙岩364012 [4]杭州市畜牧兽医局,杭州310020

出  处:《病毒学报》

基  金:国家自然科学基金项目(30771608);浙江省重点科技项目(2007C22051011102120);宁波市重大科技项目(2002D40015)

年  份:2009

卷  号:25

期  号:5

起止页码:355-361

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2008、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:鸽圆环病毒(Pigeon circovrius,PiCV)是圆环病毒科的一个成员,是一种免疫抑制性病原,鸽子感染圆环病毒后可以出现昏睡、嗜眠、厌食、体重减轻、呼吸窘迫等症状。本研究应用建立的PCR方法,检测了从浙江省5个鸽场采集的样品,结果在杭州某鸽场检测到阳性。进一步设计引物分段PCR扩增、克隆并测定了2株鸽圆环病毒的全基因组序列,分别命名为PiCV-zj1和PiCV-zj2,序列的GenBank登录号为DQ090945和DQ090944。基因组序列分析表明,PiCV-zj1及PiCV-zj2全长均为2039bp,具有圆环病毒共同的与病毒复制相关的茎环结构和Rep蛋白保守基序等特征,与已发表的国外11株鸽圆环病毒序列在全基因组核苷酸水平有86%~89.1%的同源性,在Rep和外壳蛋白的氨基酸水平分别有92.1%~94.7%和76.6%~81.4%的同源性。应用PHYLIP方法作进化树分析并应用bootstrap重复1000次进行检验,结果显示:10个欧美株组成一个大的分支,而浙江株和澳洲株各自独立分支。这是我国首次检测确认鸽圆环病毒的存在,并测定了2株PiCV病毒的全基因组序列。

关 键 词:鸽  圆环病毒 全基因组序列

分 类 号:S852.659.2]

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