期刊文章详细信息
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]怀化学院生物工程系,湖南怀化418008 [2]怀化市生物育种与加工技术实验室,湖南怀化418008
基 金:湖南省科研计划重点资助项目(编号:05A064)
年 份:2009
卷 号:37
期 号:5
起止页码:27-29
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2008、CSCD、CSCD_E2011_2012、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:利用已报道的FNDC基因序列的保守区域设计引物,用所设计的引物扩增四棱豆FNDC基因的部分序列,将序列提交GenBank,获1个登录号FJ176925。通过对该序列的同源性比较分析发现,该序列与目前数据库中山豆根YP_001511236序列具有明显的同源性。该序列在112—651bp片段上包括了1个开放性阅读框,起始密码子为ATG,终止密码子为TGA。将ORF处的氨基酸序列继续进行生物信息学的分析,对其进行的1级结构分析和2级结构分析中,表明该序列是一个酸性蛋白,亲水性较弱,疏水性较强,信号肽序列为第23位一第45位,亚细胞定位最大可能性为定位于细胞外。含有N型糖基化位点,蛋白激酶C磷酸化位点,酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,C-末端锚定微体信号,纤维素结合结构域。主要以旺一螺旋,不规则盘绕和延伸链为该蛋白最大量的结构元件,β-折叠散布于整个蛋白质中。
关 键 词:四棱豆 FN基因 序列克隆 序列分析
分 类 号:S529.01]
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同被引文献:
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