文献类型：期刊文章

作　　者：蔡艳清[1] 许东林[1] 周国辉[1]

机构地区：[1]华南农业大学资源环境学院植物病毒研究室,广东广州510642

出　　处：《华南农业大学学报》

基　　金：广东省科技计划项目(2003B21604);广东省自然科学基金(5006669)

年　　份：2009

卷　　号：30

期　　号：4

起止页码：19-23

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2008、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：为研究甘蔗杆状病毒Sugarcane bacilliform virus(SCBV)的基因组片段是否整合进杂种甘蔗Saccharuminter-spec ific hybrids基因组,以采自广西甘蔗研究所的1株杂种甘蔗植株叶片总DNA为模板,根据已报道的甘蔗杆状病毒基因组序列设计多条特异引物.经PCR扩增、产物克隆及序列分析,获得1个全长为5 364 bp的核苷酸序列.该序列具有SCBV基因组结构特征,含有2个完整的ORF,与GenBank中已报道的2个SCBV分离物之间的核苷酸及氨基酸序列同一性均大于70%,但该序列与完整的SCBV基因组全序列相比,不具备完全的ORF3,缺失了对病毒复制过程极为重要的功能性基因RNase H的序列区段.通过Southern-b lot杂交分析,初步推测其为一段整合入杂种甘蔗基因组中的SCBV基因组序列.

关 键 词：甘蔗杆状病毒  杂种甘蔗  病毒同源序列  序列分析  

分 类 号：Q939.46]