文献类型：期刊文章

作　　者：袁力赟[1] 赵中明[2] 丁国徽[3]

机构地区：[1]上海交通大学生命科学技术学院,上海200240 [2]美国范德堡大学生物医学信息学系 [3]中国科学院系统生物学重点实验室,上海200031

出　　处：《生物信息学》

年　　份：2009

卷　　号：7

期　　号：3

起止页码：202-206

语　　种：中文

收录情况：ZGKJHX、普通刊

摘　　要：KRAB锌指基因是哺乳动物中最大的转录调控因子家族,它的多数成员在基因组上成簇分布,具有五种不同的亚家族,在功能行使上承担着不同的作用。本文通过对人类、黑猩猩、小鼠、大鼠和狗五种哺乳动物全蛋白质组序列及mRNA组织表达谱分析,验证了C2H2锌指结构在单个KRAB蛋白质中出现的数目多于一般锌指蛋白质;KRAB功能域在各物种中分布显著不同且与分化时间不成正比,这表明KRAB相关功能域多样性在灵长类进化过程中潜在的适应性进化。同时,提出KRAB亚家族进化的路线:即KRAB-Aa为起始家族,Ba由Aa直接演变形成,而Ca,blonga和XRCC三种亚型可能经过Ba或直接从Aa演变形成;此外,锌指结构在单个蛋白质中出现个数伴随KRAB功能域自身的进化路线逐渐递增,反映了KRAB功能域在形成新转录调控因子方面的积极作用。

关 键 词：KRAB功能域  锌指基因 亚家族 进化

分 类 号：Q71]