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期刊文章详细信息

海南省HIV-1基因亚型分析    

HIV-1 gene subtypes in HIV positives and AIDS patients in Hainan province

  

文献类型:期刊文章

作  者:符鹏[1] 邓巍[2,3] 鲍琳琳[2,3] Nicole Vidal[4] 何启亚[1] 秦川[2,3] Martine Peeters[4] Eric Delaporte[4] Jean-Marie Andrieu[5] 王召乾[1] 邝继深[1] 张帆[1] 胡玉銮[1] 卢葳[3,4]

机构地区:[1]海南省疾病预防控制中心,海口570203 [2]北京协和医学院中国医学科学院比较医学中心 [3]北京协和医学院中国医学科学院中法合作艾滋病研究中心 [4]法国发展研究院蒙特利尔大学UMR145研究所 [5]巴黎第五大学肿瘤疫苗免疫治疗中心病毒分子研究所

出  处:《中国公共卫生》

基  金:海南省自然科学基金(807101)

年  份:2009

卷  号:25

期  号:9

起止页码:1142-1143

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2008、CAS、CSCD、CSCD_E2011_2012、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的分析海南省人类免疫缺陷病毒-1(HIV-1)基因亚型,监测HIV毒株的流行状况。方法从88份HIV-1抗体阳性的血浆中提取RNA,逆转录后采用PCR法扩增HIV-1基因序列中的env及pol基因,对扩增产物进行核苷酸序列测定,经比对分析而确定基因亚型。构建最大似然(ML)进化树,分析感染者间的传播链。结果88份样品中,有83份样品被扩增出HIV-1的env及pol基因片段;共发现6种HIV-1亚型和重组型,其中CRF01-AE亚型70份,B′亚型8份,C亚型2份,B亚型和CRF08-BC、CRF01-AE/B′重组亚型各1份。在ML进化树上83份样品分成4个传播群(66/83)和非传播群(17/83),其中传播群1最庞大(59/83)。结论海南省HIV/AIDS的HIV-1基因亚型至少有6种,其中CRF01-AE为主要亚型,占84.33%(70/83),主要分布在静脉吸毒者及其性伴侣之间,形成了一个庞大的传播群。其次为B′亚型(9.6%)。另外的4种亚型(6%)仅见单个病例。提示海南省静脉吸毒为主要的感染途径(67.5%);经性接触传播的亚型种类复杂多样,包括本次检出的全部亚型和重组株。

关 键 词:人类免疫缺陷病毒 亚型  序列分析  进化树

分 类 号:R373]

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同被引文献:

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