期刊文章详细信息
7株鸭肝炎病毒分离株及疫苗株的全基因组序列测定与变异分析
Complete Genome Sequencing and Variations Analysis of Seven Isolated Strains and One Vaccine Strain of Duck Hepatitis Virus
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]山东省农业科学院家禽研究所山东省禽病诊断与免疫重点实验室,济南250023 [2]华南农业大学兽医学院农业部养禽与禽病防治重点实验室,广州510642
基 金:山东省自然基金项目(Z2006D06);家畜疫病病原生物学国家重点实验室开放课题
年 份:2009
卷 号:40
期 号:8
起止页码:1209-1214
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2008、CAB、CAS、CSA、CSCD、CSCD2011_2012、DOAJ、EMBASE、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:为了分析中国鸭肝炎病毒(DHV)的遗传变异和进化关系,作者测定了中国不同地区分离的7株DHV及1株疫苗株的全基因组序列,并与公布的40株DHV序列进行比较分析。结果发现VP1变异程度较大,高变区主要集中在180-194位和213-219位;不同毒株的潜在N-糖基化位点存在较大差异。多数基因的进化分析均表现出一致的结果,测序的8个毒株均分布在同一个遗传谱系,属基因A型,与基因B型和基因C型遗传距离较远,不在同一分支上。而JYZ02株与R85952株的遗传距离最近,属同一个亚支,提示JYZ02株可能由毒株R85952演化而来。结合氨基酸序列相似性分析和代表毒株的血清交叉中和试验结果,表明近年分离并测序的上述7个毒株未发生抗原变异。从多毒株进化分析结果可以看出,血清1型DHV仍是我国流行的优势血清型。
关 键 词:鸭肝炎病毒 遗传变异 进化分析
分 类 号:S852.659.6]
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