文献类型：期刊文章

作　　者：杨磊[1] 李前忠[1] 左永春[1] 李涛[1]

机构地区：[1]内蒙古大学物理科学与技术学院理论生物物理研究室,呼和浩特010021

出　　处：《内蒙古大学学报（自然科学版）》

基　　金：国家自然科学基金资助项目(30560039);内蒙古自然科学基金资助项目(200607010101);内蒙古自治区优秀学科带头人资助项目(20060702)

年　　份：2009

卷　　号：40

期　　号：4

起止页码：443-448

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2008、CAS、CSCD、CSCD_E2011_2012、JST、MR、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZMATH、ZR、核心刊

摘　　要：动物毒素是一种具有非常广泛用途的生物毒素,有必要提出一种能够快速、准确预测动物毒素的理论算法.基于动物毒素蛋白质序列的二肽组分信息,提出了一种离散增量结合支持向量机的ID-SVM的算法,并使用此算法对不同序列相似性的动物毒素进行了预测,取得了较好的结果.为了说明ID-SVM算法在预测生物毒素方面的优越性,在这里将ID-SVM算法应用到Saha和R aghava构建的细菌毒素和非毒素的数据库上,预测结果显示ID-SVM算法的预测结果高于Saha和R aghava所用算法的结果.

关 键 词：动物毒素 离散增量  支持向量机 序列相似性  

分 类 号：Q61]