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彩叶草中一个富亮氨酸重复相关蛋白基因SsLRP的克隆和分析
Molecular Cloning and Analysis of a Novel Leucine-Rich Repeat Related Protein Gene,SsLRP,from Solenostemon scutellarioides (L.) Codd
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]华南农业大学生命科学学院,广东省植物功能基因组与生物技术重点实验室,广州510642 [2]西南大学园艺园林学院,西南大学花卉研究所,重庆400716
年 份:2009
卷 号:45
期 号:7
起止页码:657-662
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2008、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、JST、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:根据彩叶草叶片小型EST库中一条具有1个富亮氨酸重复(leucine-rich repeat,LRR)结构域的EST序列,采用RACE与文库结合的方法,克隆了1个具有5个LRR结构域的全长cDNA,SsLRP(LRR-Related Protein)(GenBank登录号FJ787729)。SsLRP cDNA全长1024bp,包含一个657bp的ORF框,编码218个氨基酸。其5’-UTR区含有2个终止子TAG,3’-UTR区具有推测的加尾信号AATAAA。SsLRP蛋白N端具有的信号肽和保守的亮氨酸拉链结构域,具有5个保守的LRR结构域,多个磷酸化位点和N-糖基化位点。多序列比对和系统进化分析表明,SsLRP与番茄SlLRP同源性最高。二级结构和三级结构预测表明,SsLRP的功能可能与保守的LRR结构域密切相关,推测该基因可能参与蛋白间的相互作用与信号识别。RT-PCR分析表明,SsLRP与番茄SlLRP具有相似的表达模式,在正常植株的根、茎、叶和花中都有表达,在受菌核病感染植株的茎和叶中表达上调。
关 键 词:彩叶草 富亮氨酸重复蛋白 SsLRP基因
分 类 号:S682.36]
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