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青岛裙带菜孢子体野生种群遗传多样性的AFLP分析
The Genetic Diversity Analysis of the Sporophytes of Undaria pinnatifida (Phaeophyceae) for Qingdao Population by AFLP Markers
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中国海洋大学海洋生物遗传学与种质工程实验室,山东青岛266003
基 金:山东省908专项(SD-908-01-01-05.06)资助
年 份:2009
卷 号:39
期 号:4
起止页码:664-668
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2008、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZMATH、ZR、核心刊
摘 要:采用优化的基因组总DNA提取方法,按照经典的AFLP分析路线,对30株青岛近海野生裙带菜(Undaria pinnatifida)孢子体种群内遗传多样性进行了AFLP分析。利用1对引物扩增出38条清晰可重复的带,其中32条呈现多态性,多态位点比例为84.21%,根据引物扩增的指纹图谱,计算出的种群内部平均观测等位基因数(Na)为1.8421、平均有效等位基因数(Ne)为1.3754、平均基因多样性指数,即Nei’s基因多样性指数(H)为0.2351,Shannon’s多样性信息指数(I)为0.3684。该种群内遗传距离的分布范围从0.0267-0.8044,结果显示,野生种群内个体间各项遗传指数水平均较高,种群内遗传变异丰富。聚类分析表明,在遗传距离为0.21的阈值处,30个个体划分为2大类群,推测青岛野生裙带菜进化上在遗传距离为0.21时发生第一次分化。
关 键 词:裙带菜 孢子体 遗传多样性 AFLP
分 类 号:P714.5[海洋科学类;海洋工程类] Q943[植物生产类]
参考文献:
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引证文献:
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