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小孢子链格孢OPA2-1核苷酸序列分析及系统发育研究
Sequence and phylogenetic analysis of OPA2-1 region from Alternaria small-spored species
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]西北农林科技大学植物保护学院,杨凌712100 [2]西藏大学农牧学院农学系,林芝860000
基 金:国家自然科学基金(No.30771735);教育部长江学者和创新团队发展计划资助项目(No.IRT0748);高等学校学科创新引智计划项目(No.B07049)
年 份:2009
卷 号:28
期 号:4
起止页码:553-557
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2008、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:本研究采用引物对OPA2-1L/OPA2-1R对供试小孢子链格孢菌株OPA2-1区段进行扩增,所有菌株都可获得PCR产物。核苷酸序列分析表明:不同小孢子链格孢种OPA2-1核苷酸序列存在明显差异。利用邻近结合法构建系统发育树,供试菌株被分为8个组,梨黑斑链格孢Alternaria gaisen、长柄链格孢A.longipes、树状链格孢A.arborescens明显被归于不同分支,显示OPA2-1核苷酸序列对这些种均具有区分能力;链格孢A.alternata的一些不同分离物被聚在不同组中,说明链格孢A.alternata存在明显遗传差异,可能为一个复合体。OPA2-1核苷酸序列富于变化,可作为小孢子链格孢系统发育研究的一种有用的手段。
关 键 词:链格孢属 系统发育 分类 鉴定
分 类 号:Q93]
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