文献类型：期刊文章

作　　者：李梅[1] 白凤兰[1]

机构地区：[1]大连交通大学理学院,辽宁大连116028

出　　处：《生物数学学报》

年　　份：2009

卷　　号：24

期　　号：2

起止页码：374-378

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2008、CSCD、CSCD2011_2012、JST、MR、ZMATH、核心刊

摘　　要：在DNA序列相似性的研究中,通常采用的动态规划算法对空位罚分函数缺乏理论依据而带有主观性,从而取得不同的结果,本文提出了一种基于DTW(Dynamic Time Warping,动态时间弯曲)距离的DNA序列相似性度量方法可以解决这一问题.通过DNA序列的图形表示把DNA序列转化为时间序列,然后计算DTW距离来度量序列相似度以表征DNA序列属性,得到能够比较DNA序列相似性度量方法,并用这个方法比较分析了七种东亚钳蝎神经毒素(Buthus martensi Karsch neurotoxin)基因序列的相似性,验证了该度量方法的有效性和准确性.

关 键 词：DNA序列 时间序列 DTW距离  

分 类 号：Q71]