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期刊文章详细信息

猪胸膜肺炎放线杆菌ApxIIA基因的序列分析及其B细胞表位预测    

Analysis of Genome Sequence of App ApxIIA and Its Prediction of Related B Cell Epitopes

  

文献类型:期刊文章

作  者:李任峰[1] 田香勤[2] 何启盖[3] 王自良[1] 赵坤[1] 李学斌[1] 王三虎[1]

机构地区:[1]河南科技学院动物科学学院,新乡453003 [2]新乡医学院医学研究中心,新乡453003 [3]华中农业大学动物医学院农业微生物学国家重点实验室动物病原分室,武汉430070

出  处:《生物技术通报》

基  金:河南省技术与前沿技术研究项目(082300430020);河南科技学院青年教师创新基金项目(20065053)

年  份:2009

卷  号:25

期  号:7

起止页码:104-108

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2008、CAS、CSCD、CSCD_E2011_2012、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:摘要:为了进一步研究猪胸膜肺炎放线杆菌(Actionobacillus pleuropneumoniae,App)ApxⅡA基因的结构和功能,选取GenBank中6株不同App分离株,采用生物信息学方法对其ApxⅡA基因及其编码氨基酸序列进行同源性比对,并选择其中AY232288.1菌株(湖北分离株)ApxⅡA基因为研究对象,分析该基因所编码蛋白质的理化性质,并对其可能形成的二级结构及B细胞表位进行预测和分析。结果表明,6株不同App分离株ApxⅡA基因核苷酸及氨基酸序列同源性分别为65.56%和88.42%,在AY232288.1菌株ApxⅡA蛋白的肽链中,745—751和801—807区段可能是其B细胞表位优势区。本研究首次利用生物信息学方法对ApxⅡA基因及其蛋白质结构进行了分析和预测,为ApxⅡA基因功能的深入研究及APP多表住疫苗的设计奠定了基础。

关 键 词:猪胸膜肺炎放线杆菌 ApxIIA基因  B细胞表位

分 类 号:S852.61]

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