文献类型：期刊文章

作　　者：马芬[1] 吴凤霞[2] 李宁[3] 柳青[1] 杨威[1] 张学[3] 孙森[1]

机构地区：[1]中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础医学院医学遗传学系McKusick-张孝骞医学遗传中心医学分子生物学国家重点实验室,北京100005 [2]辽宁省锦州医学院第一附属医院 [3]中国医科大学

出　　处：《中华医学遗传学杂志》

基　　金：国家自然科学基金面上项目（30871355）

年　　份：2009

卷　　号：26

期　　号：3

起止页码：336-339

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2008、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EMBASE、IC、JST、PUBMED、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的 应用Affymetrix全基因组芯片结合荧光定量PCR（quantitative real-timePCR，qPCR）技术，进行致病性DNA拷贝数变异的精细定位研究。方法以一个定位于染色体7q36的中国人遗传性三节拇指多并指综合征伴随Ⅳ型并指家系中的一例患者为研究对象。收集外周血标本，常规提取基因组DNA。应用Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array6．0芯片，将基因组DNA纯化，经过酶切、连接、扩增、标记、杂交、染色和扫描等步骤后得到原始数据，应用Affymetrix Genotyping Console3．0软件进行拷贝数分析。在经芯片分析所确定的重复范围内设计引物，采用qPCR方法进行验证，并进一步缩小断端范周、精确重复区域范围。结果将患者重复区域两断端范围由原来的113kb和33kb分别缩小到5．4kb和1．8kb，致病性DNA重复范围由原来的291～437kb精确至379～387kb。结论应用Affymetrix全基因组芯片联合qPCR技术可以实现对DNA拷贝数突变的精确、可靠的检测。

关 键 词：AFFYMETRIX SNP芯片  荧光定量PCR DNA重复  

分 类 号：R686]