文献类型：期刊文章

作　　者：范京安[1] 顾海丰[2] 陈世界[1] 莫帮辉[3] 温演庆[1] 何万兴[1] 刘伟[1] 曾晓茂[2]

机构地区：[1]四川出入境检验检疫局 [2]中国科学院成都生物研究所,成都610041 [3]中国科学院成都计算机应用研究所,成都610041

出　　处：《应用与环境生物学报》

基　　金：国家自然科学基金项目(No.30570250);国家质检总局科技计划项目(No.2007IK242);国家重点基础研究发展规划项目(No.2004CB318003);中国科学院知识创新重要方向基金项目(No.KJCX2-YW-S02)资助~~

年　　份：2009

卷　　号：15

期　　号：2

起止页码：215-219

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2008、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：选用双翅目实蝇科12属36种55个样本为材料,将其DNA条形码(mtDNACOI基因648bp)与微型DNA条形码(mtDNACOI基因50～200bp)数据进行比较分析,探讨微型DNA条形码对果实蝇物种鉴定的可行性.采用虚拟实验(Silico analysis),将BOLD数据库中49个样本的序列分别拆成648bp、160bp、50bp三个片段,通过构建NJ树,并进行遗传距离分析,得出每个片段鉴定物种的准确性依次为100%、94%、84%.同时做了实体实验(Empirical test),得到了果实蝇属6个物种的COI序列,将其与虚拟实验中的49个样本序列合并,以DNA-barcode指定序列5’端160bp序列为分析基础,通过遗传距离分析,得出其鉴定物种的准确性为94%,验证了虚拟实验结果.即微型DNA条形码(Minimalistbarcode)鉴定果实蝇物种的准确性与DNA条形码基本一致,均可作为果实蝇物种鉴定的有效依据.

关 键 词：实蝇科 COI基因 DNA条形码 微型DNA条形码  物种鉴定

分 类 号：S41]