文献类型：期刊文章

作　　者：侯琳[1,2] 钱敏平[1,3] 朱云平[2] 邓明华[1,3]

机构地区：[1]北京大学数学科学学院,北京100871 [2]军事医学科学院放射与辐射医学研究所,北京蛋白质组研究中心,蛋白质组学国家重点实验室,北京100850 [3]北京大学理论生物学中心,北京100871

出　　处：《遗传》

基　　金：国家自然科学基金项目(编号:30570425);国家重点基础研究发展计划项目(编号:2003CB715903);国家高技术研究发展计划项目(编号:2006AA02Z331;2008AA02Z306)资助

年　　份：2009

卷　　号：31

期　　号：4

起止页码：365-373

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2008、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：转录因子结合位点(Transcription factor binding site,TFBS)是与转录因子结合的DNA序列,它们与转录因子相互作用调控基因的转录过程。确定TFBS是理解转录调控机制,建立转录调控网络的关键问题。随着高通量实验技术的发展,结合ChIP-chip实验以及多个基因组的序列信息来预测TFBS已成为新的研究热点。本文简要概述了用于TFBS定位的实验技术,TFBS信息相关的数据库,重点评述了描述TFBS的模型以及预测TFBS的多种软件。TFBS的生物信息学研究的发展,将与相关领域相互促进,有助于进一步揭示转录调控机制。

关 键 词：转录因子结合位点 生物信息学 ChIP—chip  位置权重矩阵 系统发育足迹分析法  

分 类 号：Q75]