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传统分离培养结合DGGE法检测榨菜腌制过程的细菌多样性
Analysis of Bacterial Diversity During the Processing of Brassica juncea coss var. tsatsai by the Culture-independent and Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE) Methods
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]重庆大学生物工程学院基因工程研究中心重庆市高校功能基因与调控新技术重点实验室,重庆400044 [2]重庆涪陵榨菜(集团)有限公司,重庆408000
基 金:重庆市科委自然基金重点项目(No.CSTC2007BA1005)
年 份:2009
卷 号:36
期 号:3
起止页码:371-376
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2008、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:采用传统分离培养和基于16S rRNA作为分子标记的变性梯度凝胶电泳(Denaturing gra-dient gel electrophoresis,DGGE)的方法,分析榨菜腌制过程中不同时期的可培养细菌数量、多样性及其群落结构。结果表明,用传统分离与分子鉴定方法获得7个属的细菌类群,其中乳杆菌属(Acidobacterium)是优势菌群,明串珠菌属(Leuconostoc)是次优势菌群。对通过DGGE方法得到的11条16S rRNA优势条带序列进行了比对,结果表明明串珠菌属(Leuconostoc)的丰度最高,是腌制过程中主要的优势菌群,乳球菌(Lactococcus lactis)是次优势菌。传统分离法与DGGE法结合能够更有效的分析榨菜腌制过程中微生物的多样性及其动态变化,获得更全面的微生物多样性信息。
关 键 词:榨菜(Brassica JUNCEA coss var.tsatsai) 16S rRNA 传统分离培养 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 群落多样性
分 类 号:TS255.4]
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