文献类型：期刊文章

作　　者：薛永常[1] 聂会忠[1] 刘长斌[1]

机构地区：[1]大连工业大学生物与食品工程学院辽宁省发酵工程重点实验室,大连116034

出　　处：《生物信息学》

基　　金：辽宁省自然科学基金(20062146);辽宁省教育厅科学研究项目(20040091)

年　　份：2009

卷　　号：7

期　　号：1

起止页码：13-17

语　　种：中文

收录情况：ZGKJHX、普通刊

摘　　要：应用生物信息学的方法对GenBank中拟南芥、火炬松、胡麻、紫花罗兰等植物香豆酸-3-羟基化酶(c3h)基因以及本实验室克隆的欧美杨107的c3h基因(AM920690)核苷酸序列以及翻译的氨基酸序列的组成成分、导肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二级结构及功能域等进行了初步分析预测。分析表明欧美杨107的C3H氨基酸序列不存在导肽,无跨膜结构域,肽链表现为亲水性;二级结构域与P450高度匹配,其高级结构中含有由含铁血红素和半胱氨酸组成的活性中心,并构建了c3h进化树,对其分子进化进行了探讨。

关 键 词：香豆酸-3-羟基化酶  生物信息学 分子进化

分 类 号：Q75]