文献类型：期刊文章

作　　者：方洪波[1] 米洋[1] 张业[1] 沈珝琲[1]

机构地区：[1]中国医学科学院基础医学研究所/北京协和医学院基础医学院,医学分子生物学国家重点实验室,北京100005

出　　处：《科学通报》

基　　金：国家自然科学基金(批准号:90408007和30721063);国家重点基础研究发展计划(批准号:2004CB518605)资助项目

年　　份：2009

卷　　号：54

期　　号：1

起止页码：46-52

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2008、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、EI、IC、JST、MR、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：为研究全反式维甲酸(all-trans retinoic acid,ATRA,简称RA)诱导人类神经细胞分化的表观遗传调控机制,应用染色质免疫沉淀与启动子芯片联合技术(ChIP-on-chip),对RA诱导24h后神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞中两万余个基因启动子区的组蛋白H3乙酰化修饰状态进行了高通量检测和分析.首先分别制备RA处理组和对照组的标记探针,然后将人类基因组启动子芯片与探针进行杂交,获得RA诱导SH-SY5Y细胞分化早期全基因组启动子区H3组蛋白乙酰化的数据.结果分析显示,RA处理导致597个基因启动子的乙酰化程度显著升高、647个基因降低.本研究结果显示上述技术的高效与可行,并为深入研究RA诱导分化相关基因的表观遗传调控机制奠定了基础.

关 键 词：全反式维甲酸(RA)  染色质免疫沉淀 启动子芯片  细胞分化  组蛋白乙酰化

分 类 号：R96]