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期刊文章详细信息

氨基酸描述子VHSEH用于多肽定量序效建模研究  ( EI收录)  

VHSEH Descriptors for the Development of QSAMs of Peptides

  

文献类型:期刊文章

作  者:杨善彬[1,2,3] 夏之宁[1,2] 舒茂[1,2] 梅虎[1,2] 吕凤林[4] 张梅[5] 吴玉乾[2] 李志良[1,2]

机构地区:[1]重庆大学生物工程学院,重庆400044 [2]重庆大学化学化工学院,重庆400044 [3]宜宾学院化学与化工系,宜宾644000 [4]第三军医大学野战外科研究所,重庆400038 [5]重庆大新药业有限公司质检部,重庆400700

出  处:《高等学校化学学报》

基  金:国家'八六三'计划(批准号:2006AA02Z312);化学生物传感与计量学国家重点实验室基金(批准号:2005012)资助

年  份:2008

卷  号:29

期  号:11

起止页码:2213-2217

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2004、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EI(收录号:20090111826605)、IC、JST、RCCSE、RSC、SCIE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:从20种天然氨基酸的171个物化性质出发,按照疏水、立体和电性特征及氢键贡献将其分类后,分别进行主成分分析,得到一个新描述子VHSEH(Principal component score vector of hydrophobic,steric,electronic properties and,hydrogen bonds contributions).对后叶催产素的结构进行了表征,并以偏最小二乘法及D-优化划分样本建立了PLS定量序效关系模型,得到复相关系数R2分别为0.958和0.957,Q2分别为0.903和0.845,约高于VHSE描述子模型值;对抗菌肽进行了结构表征,建立了PLS和OSC-PLS模型,其R2分别为0.84和0.995,Q2分别为0.546和0.926,较SZOTT描述子结果好;对58个血管紧张素转化酶抑制剂进行QSAM研究,得到R2,Q2及RMS分别为0.877,0.838和0.361.研究结果表明,VHSEH描述子信息量大,物化意义明确,结果更易解释.

关 键 词:氨基酸描述子(VHSEH)  肽  定量序效建模(QSAM)  偏最小二乘法

分 类 号:O629.72] O641[化学类]

参考文献:

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耦合文献:

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引证文献:

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同被引文献:

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