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期刊文章详细信息

转录因子结合位点的计算分析方法    

TUTORIAL FOR COMPUTATIONAL ANALYSIS OF TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITES

  

文献类型:期刊文章

作  者:李婷婷[1] 蒋博[1] 汪小我[1] 张学工[1]

机构地区:[1]清华大学生物信息学教育部重点实验室,清华信息科学与技术国家实验室(筹)生物信息学研究部,清华大学自动化系,北京100084

出  处:《生物物理学报》

基  金:国家自然科学基金项目(60575014;30625012;60721003);国家863项目(2006AA02Z325)的资助;清华大学信息学院基础研究基金~~

年  份:2008

卷  号:24

期  号:5

起止页码:334-347

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2004、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、JST、ZGKJHX、核心刊

摘  要:基因组上众多基因和非编码转录体按照特定的规律有序地表达是细胞正常生命活动的基础。转录调控是基因表达调控的关键步骤,转录因子结合在基因启动子序列中的转录因子结合位点,启动基因的转录和控制基因的转录效率。分析转录因子结合位点对研究基因调控系统有着重要意义,生物信息学在转录因子结合位点的研究中发挥着关键的作用。文章综述了分析蛋白质编码基因的转录因子结合位点的典型流程,总结了主要的算法、软件和资源,并简要评述了目前非编码RNA转录调控的研究现状。

关 键 词:转录因子结合位点 模体识别 模体定位  非编码RNA转录调控  生物信息学

分 类 号:Q61]

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同被引文献:

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