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期刊文章详细信息

蛋白顺序性抗原决定簇的多参数综合预测    

THE MULTI-PARAMETER PREDICTION OF POTENTIAL PROTEIN ANTIGENIC DETERMINANTS

  

文献类型:期刊文章

作  者:万涛[1,2] 孙涛[1,2] 吴加金[1,2]

机构地区:[1]北京电子工业部402医院 [2]军事医学科学院基础医学研究所

出  处:《中国免疫学杂志》

年  份:1997

卷  号:13

期  号:6

起止页码:329-333

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX1996、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:通过分析氨基酸序列的某些参数,可达到预测抗原决定簇。但没有一种单参数预测获得较满意结果,故有必要进行多参数联立综合预测。选用6个参数加权叠加。首先假设形成表位的残基上的原子数正比于N2/3(N为整蛋白中残基原子数),再对34个共含169个已知抗原位点的蛋白进行训练性综合预测,选出最佳权重。结果表明,Hopp&Woods亲水性参数和Janin可及性参数在综合中很重要。对CRGP,SCX2-ANDAN,TNFA-HUMAN,SOMA-BOVIN,HS7H-HUMAN这5个已知位点蛋白进行回顾性分析,初次预测率为45.8%,再配以β-转角结构,二次预测率为47.4%,结果可提供实验参考。

关 键 词:抗原决定簇 蛋白质 计算机

分 类 号:R392.11]

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