文献类型：期刊文章

作　　者：徐志广[1] 许旋[1] 袁传能[1]

机构地区：[1]华南师范大学化学与环境学院,广东高校电化学储能与发电技术重点实验室,广州510006

出　　处：《物理化学学报》

基　　金：广东省自然科学基金(5005938);广东省教育部产学研结合专项资金(2007A09030246)资助项目

年　　份：2008

卷　　号：24

期　　号：10

起止页码：1839-1844

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2004、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EBSCO、IC、INSPEC、JST、PUBMED、RCCSE、RSC、SCIE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：采用InsightII/Affinity对紫杉醚与αβ微管蛋白进行分子对接,共得到10个对接构象.应用密度泛函B3LYP/6-31G方法计算对接口袋构象的结合能,筛选出结合能达-190.53kJ·mol-1的最优对接构象5.通过构象分析建立紫杉醚与受体结合的作用模型,结果表明,在活性口袋的底部紫杉醚与受体间的作用主要是疏水作用,而在活性口袋的顶部两者间主要是氢键作用.氢键作用位置可分为A和B两个作用区,其中A区有3个氢键,由C13侧链分别与受体的ASP26和ARG369作用形成;B区也有3个氢键,是由紫杉醚母环上的极性基团分别与受体的THR276、ARG278和GLN282作用产生的.紫杉醚与αβ微管蛋白间形成的6个氢键可以有效地将紫杉醚固定在活性口袋中.

关 键 词：紫杉醚  αβ微管蛋白  分子对接

分 类 号：R91[药学类]