文献类型：期刊文章

作　　者：燕勇[1] 李卫平[1] 高雯洁[1] 沈志英[1] 王恒辉[1] 陈黎霞[1]

机构地区：[1]浙江省嘉兴市疾病预防控制中心,浙江嘉兴314050

出　　处：《中国卫生检验杂志》

基　　金：浙江省档案局科研项目(2007-9)

年　　份：2008

卷　　号：18

期　　号：10

起止页码：1958-1961

语　　种：中文

收录情况：CAS、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的:通过对3株真菌的rDNA-ITS序列进行分析,以探讨、说明基于核糖体RNA基因(即rDNA)内转录间隔区(Internal Transcribed Spacer,ITS)的多态性的序列分析(rDNA-ITS序列分析)在真菌鉴定中的应用。方法:通过PCR扩增与测序的方法测得待检真菌菌株的rDNA-ITS序列,从GENBANK获取相似序列,使用BLAST和DNAMAN工具对rDNA-ITS序列进行比对分析。结果:1号真菌菌株与Xylariales sp.LM40(属炭角菌目)同源性高,但尚不能鉴定到具体的属、种;2号真菌菌株可鉴定到种,为草酸青霉Penicillium oxalicum;3号真菌菌株可鉴定到种内组水平,为近平滑假丝酵母III组(最新命名为Candida metapsilosis)。结论:相对于传统的真菌形态学鉴定方法,rDNA-ITS序列分析用于真菌鉴定更客观、省时、简便、快速,但目前也存在一定的应用限制(受基因库的完善程度、高度同源性序列的多少以及具体物种ITS区的可变程度等影响)并不能鉴定出所有真菌,宜与传统的形态学鉴定方法相结合用于真菌鉴定。

关 键 词：RDNA 内转录间隔区(ITS)  PCR 测序 真菌 鉴定  

分 类 号：R446.5]