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三种鳜鱼(Siniperca)生长激素基因的克隆及序列比较
COMPARISON IN CLONING AND SEQUENCE OF GROWTH HORMONE GENE IN THREE SPECIES OF GENUS SINIPERCA
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]长沙大学生物工程与环境科学系,长沙410003 [2]湖南农业大学动物科技学院,长沙410128 [3]上海海洋大学生命科学与技术学院,上海200090
基 金:国家自然科学基金项目资助,30640015号、30771644号;湖南省自然科学基金项目资助,06JJ20056号;湖南省教育厅重点项目资助,08A015号
年 份:2008
卷 号:39
期 号:4
起止页码:354-361
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2004、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:采用长片段PCR及T-A克隆技术,从基因组DNA成功克隆翘嘴鳜、大眼鳜和斑鳜含完整阅读框的生长激素(GrowthHormone,GH)基因DNA全序列,翘嘴鳜序列全长5548bp,大眼鳜序列全长5483bp,斑鳜序列全长5789bp,提交GenBank数据库后获得注册号分别为EF205280、EF205281、EF441623。三种鳜鱼GH基因均由六个外显子、五个内含子组成;均在第二内含子中相同位置发现"AG"微卫星重复序列;均在第三内含子末端发现一处剪接位点序列的相邻重复。三种GH基因在第一、二、三内含子处存在碱基长度差异。序列间差异主要表现为邻近序列的重复、DNA片段的缺失或插入及单核苷酸多态性(SNP)。翘嘴鳜与大眼鳜GH基因编码氨基酸序列完全相同,两者与斑鳜序列在第150位有一个氨基酸残基差异。采用MEGA软件对三种鳜鱼GH基因DNA序列及编码氨基酸序列分别构建UPGMA系统发育树,结果表明,在系统发育中,斑鳜可能最先从共有祖先物种中分化出来。
关 键 词:鳜类 生长激素基因 DNA序列 序列差异
分 类 号:Q75]
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