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我国五大淡水湖日本沼虾线粒体COI基因部分片段序列比较
Sequence analysis of mitochondrial COI gene of Macrobrachium nipponense from the five largest freshwater lakes in China
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]上海海洋大学省部共建水产种质资源创新与利用重点实验室,上海200090
基 金:上海市科委基础重大项目(06DJ14003);上海市水产办项目(2005-06);上海市重点学科建设项目(Y1101)
年 份:2008
卷 号:32
期 号:4
起止页码:517-525
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2004、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、JST、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:对我国五大淡水湖日本沼虾100个野生个体的线粒体细胞色素氧化酶亚基I(COI)部分序列进行了测定和分析,经比对获得578bp核苷酸片段,发现49个变异位点,得到35个单倍型,包括7个共享单倍型,各群体都具有较好的单倍型多态性和核苷酸多态性,其中鄱阳湖群体遗传多样性相对最高。AMOVA分析表明,五群体间总遗传分化系数Fst=0.3187(P<0.05),群体间具有较高的遗传分化。MEGA3.1软件计算五群体的Kimura2-paramter遗传距离,洞庭湖群体和巢湖群体之间的遗传距离最远为0.0191,巢湖群体和洪泽湖群体之间的遗传距离最近为0.0051。以同属胖掌沼虾(Macrobrachium inflatum)为外群分别构建了NJ和UPGMA系统树,结果显示洞庭湖和鄱阳湖为一族群,太湖、巢湖和洪泽湖为一族群。
关 键 词:日本沼虾 细胞色素氧化酶亚基Ⅰ 遗传多样性 中国五大淡水湖
分 类 号:Q785] S917[水产类]
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