文献类型：期刊文章

作　　者：张建华[1] 王海涛[2] 张芳琳[2]

机构地区：[1]郑州大学生物医学工程系,郑州450001 [2]第四军医大学基础部微生物教研室

出　　处：《山西医科大学学报》

基　　金：河南省自然科学计划基金资助项目(2008A310019)

年　　份：2008

卷　　号：39

期　　号：7

起止页码：582-584

语　　种：中文

收录情况：CAS、JST、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的利用生物信息学分析单纯疱疹病毒2型(HSV-2)基因序列的特点,设计HSV-2诊断芯片的Oligo探针。方法利用Matlab7.0和ANTHEPROTV5对HSV-2序列进行分析,并通过BLAST软件对HSV-2的DNA序列进行序列比对,得到有意义的特异序列;用生物学软件Oligo6.0设计特异性高、Tm值相近、长度均一的Oligo探针。结果利用Matlab7.0和ANTHEPROTV5分析HSV-2二级结构的分布以及其理化性质,同时生物学软件Oligo6.0获得13条60-merOligo探针。结论通过生物信息学设计HSV-2诊断芯片的探针,可为后期打印成DNA芯片,用于HSV-2的检测打下基础。

关 键 词：单纯疱疹病毒2型 MATLAB7.0 BLAST Oligo探针  

分 类 号：R318.04[生物医学工程类]