期刊文章详细信息
富集文库—菌落原位杂交法筛选栉孔扇贝的微卫星标记
Isolation and characterization of microsatellite markers for Zhikong scallop by screening SSR-enriched library
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中国海洋大学海洋生命学院海洋生物遗传与种质工程实验室,山东青岛266003
基 金:国家"十一五"支撑计划项目(2006BAD09A09);国家科技基础条件平台建设(2005DKA30470);农业科技成果转化资金项目(2006GB23600451)
年 份:2008
卷 号:32
期 号:3
起止页码:353-361
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2004、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:应用微卫星富集文库——菌落原位杂交法,筛选得到了40个栉孔扇贝的微卫星标记。用固定了(AG)15和(AC)15探针的尼龙膜(HybondN^+)捕捉含有微卫星DNA的片段,经洗脱、PCR扩增和TA克隆,构建栉孔扇贝的微卫星富集文库。利用ECL试剂盒(Amersham公司)标记的(AG)15和(AC)15探针进行菌落原位杂交筛选微卫星富集文库,阳性克隆经测序获得微卫星DNA。富集文库中1200个重组克隆经过菌落原位杂交后,532个(44.3%)为阳性克隆。任意挑选100个克隆测序,结果显示所有的克隆都至少含有一个微卫星位点。利用软件设计了65对特异性PCR引物,40对能扩增出清晰的带谱;利用48个栉孔扇贝个体评价微卫星位点,分析表明37个位点具有多态性。不同的位点获得的等位基因数目为2~14个不等,37个多态性位点共获得258个等位基因,平均每个位点获得7.0个等位基因。观测杂合度(H0)、期望杂合度(HP)及多态性信息含量值(P配)的范围分别为0.1000-1.0000、0.1197-0.9831和0.1172-0.9782。结果表明,富集文库一菌落原位杂交法适合大规模筛选目标物种的微卫星标记。
关 键 词:栉孔扇贝 富集文库 菌落原位杂交 微卫星标记 多态性
分 类 号:S917[水产类]
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