文献类型：期刊文章

作　　者：庄静[1] 周熙荣[2] 孙超才[2] 管帮超[3] 彭日荷[4] 乔玉山[1] 章镇[1] 高峰[4] 蔡斌[4] 熊爱生[4] 姚泉洪[4]

机构地区：[1]南京农业大学园艺学院 [2]上海市农业科学院作物育种栽培研究所,上海201106 [3]上海市崇明县农业技术推广中心,上海202150 [4]上海市农业科学院生物技术研究所,上海201106

出　　处：《中国生物工程杂志》

基　　金：国家“863”计划(2006AA10Z117,2006AA06Z358);上海市青年科技启明星和优秀学科带头人计划(06XD14017)资助项目

年　　份：2008

卷　　号：28

期　　号：5

起止页码：29-40

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2004、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、IC、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：AP2/ERF转录因子家族是植物中广泛存在的一类转录因子,AP2/ERF这类转录因子主要参与植物的细胞周期、生长发育以及生物和非生物胁迫相关基因的表达调控。由于拟南芥和油菜同属于芸薹属,具有相似的基因信息,利用油菜UniGene数据库,以拟南芥ERF转录因子保守序列为探针,通过电子克隆从一个UniGene C luster中分离得到三个同类的AP2/ERF转录因子,从cDNA序列、氨基酸序列的相似性、组成成分、理化性质、疏水性/亲水性分析、序列比对、进化树、功能域、二级结构、三级结构、无序化特性进行了预测和较为全面的分析。结果显示油菜来源的BnaERF1、BnaERF2和BnaERF3属于AP2/ERF转录因子的B-2亚族,是亲水性蛋白,在蛋白质的三级结构上与AtERF1相似。蛋白质无序化分析发现,油菜BnaERF1、BnaERF2和BnaERF3无序化程度小于拟南芥AtERF1。设计引物通过PCR和RT-PCR方法分别从甘蓝型双低油菜沪油15幼苗的DNA和cDNA中扩增了上述基因,初步分析BnaERF2没有内含子,BnaERF1和BnaERF3有内含子。另外,通过EST丰度分析显示,该类转录因子的表达最高峰在种子中,其次为花,在芽、茎和分生组织中没有检测出表达的存在。

关 键 词：AP2/ERF转录因子  克隆 生物信息学 甘蓝型油菜 沪油15

分 类 号：S565.4]