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棕熊蛔虫ITS rDNA的PCR扩增与序列分析
CLONING AND SEQUENCE ANALYSIS OF ITS RDNA OF ASCARID NEMATODES FROM URSUS ARCTOS
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]广州动物园,广州510070 [2]华南农业大学兽医学院,广州510642
基 金:教育“长江学者和创新团队发展计划”创新团队项目(IRT0723)
年 份:2008
卷 号:16
期 号:3
起止页码:1-5
语 种:中文
收录情况:CAS、ZGKJHX、普通刊
摘 要:目的以核糖体DNA(rDNA)的第一与第二内转录间隔区序列(ITS-1及ITS-2)鉴定从广州动物园棕熊分离的蛔虫种类。方法应用PCR方法以保守引物NC5和NC2扩增蛔虫样本的ITS及5.8SrDNA序列,将PCR扩增出的片段纯化后克隆至pGEM-TEsay载体,用菌落PCR及酶切鉴定阳性菌落,对阳性菌落进行测序,并与Gen.Bank“公布的人蛔虫(Ascaris lumbricoides)、猪蛔虫(Ascariis suum)、浣熊贝利斯蛔虫(Baylisascaris procyonh)及狮弓蛔虫(Toxascaris leonina)ITS序列比较。结果从棕熊分离的2个蛔虫样本的ITS及5.8SrDNA总长为859—861bp,种内相似性为99.7%,与GenBank^TM公布的人蛔虫、猪蛔虫、浣熊贝利斯蛔虫及狮弓蛔虫的相似性分别为84.6%、84.5%、89.3%及72.3%,序列差异明显。结论棕熊蛔虫不同于上述种类蛔虫,可能为Baylisacaris transfuga.
关 键 词:棕熊 蛔虫 内转录间隔区(ITS) PCR扩增 序列比较
分 类 号:S865.312.731]
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