期刊文章详细信息
中国南方部分黄牛品种mtDNA D-loop区的遗传变异与分类分析
The analysis of genetic variation of mtDNA D-loop region and phylogenesis on some southern Chinese cattle breeds
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]西北农林科技大学动物科技学院,陕西省农业分子生物学重点实验室,陕西杨凌712100 [2]徐州师范大学细胞与分子生物学研究所,江苏徐州221116
基 金:国家自然科学基金项目(30471238);西北农林科技大学拔尖人才基金项目
年 份:2008
卷 号:36
期 号:5
起止页码:7-11
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2004、CAB、CSCD、CSCD2011_2012、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:【目的】检测中国黄牛品种的遗传多样性和遗传亲缘关系。【方法】扩增、测序并分析了8个南方黄牛品种(川南牛、务川牛、温岭牛、隆林牛、湘西牛、郧巴牛、昭通牛、锦江牛)共计40个个体的线粒体D-loop区(mtDNAD-loop)全序列。【结果】共检测到56个变异位点,17个单倍型,平均核苷酸差异(K)为20.364,核苷酸多样度(π)为2.25%,单倍型多样度(Hd)为0.750±0.074;4种碱基A、T、C、G的频率分别为33.2%,28.2%,25.1%和13.5%;56处多态位点中,转换49处(占多态位点87.5%),颠换4处(占7.14%),缺失/插入3处(占5.36%);在样本数量超过3的群体中,锦江牛和昭通牛分别显示出最贫乏和最丰富的遗传多样性;构建的NJ进化树表明,云南昭通牛与其他7个品种的亲缘关系最远。【结论】普通牛较瘤牛具有丰富的遗传多样性,支持普通牛的多地区起源说;云南昭通牛含有不同于印度瘤牛的瘤牛血统,从分子水平上支持云南是潜在的瘤牛起源驯化中心。
关 键 词:黄牛 线粒体D-LOOP区 遗传多样性
分 类 号:S823.810.2]
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