文献类型：期刊文章

作　　者：邱洁[1] 郭锡熔[1] 李晓南[2] 王玢[1] 倪毓辉[1] 张敏[1] 吴伟玲[2] 陈荣华[2]

机构地区：[1]南京医科大学附属南京妇幼保健院儿科,南京210004 [2]南京医科大学儿科医学研究所,南京210029

出　　处：《实用儿科临床杂志》

基　　金：国家自然科学基金项目资助(30571978);江苏省高校自然科学基金项目资助(06KJB320072)

年　　份：2008

卷　　号：23

期　　号：7

起止页码：495-497

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2004、CAS、CSCD、CSCD_E2011_2012、IC、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的验证新基因NYGGF4在肥胖患儿脂肪组织中的表达,初步探讨NYGGF4的生物信息学特征。方法采用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术验证肥胖与健康儿童脂肪组织中NYGGF4基因的表达差异,应用DNA Star、Blast、ProtParam、SOPMA、TargetP、TMHMM、ProtScale、SOSUI、InterproScan和SMART等软件或数据库分析NYGGF4的核苷酸基本特征、蛋白质理化性质、二级结构、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、可溶性、结构域及亚细胞定位等。采用SPSS 11.0软件进行统计学分析。结果NYGGF4基因是一个未知的新基因,差异高表达于肥胖患儿脂肪组织中,生物信息学分析该基因cDNA全长1 527 bp,开放阅读框(ORF)长753 bp,编码250个氨基酸,预测相对分子质量28 271,定位在胞质,蛋白序列分析显示无跨膜螺旋结构,为一非分泌、可溶的亲水性蛋白,蛋白结构域分析提示NYGGF4的N端有一较短的亲脂性靶向序列、C端有一PTB结构域。结论NYGGF4基因是一差异高表达于肥胖患儿脂肪组织中的新基因,可能是胞质内一个信号转导分子,在肥胖的发生发展过程中发挥重要功能,有进一步研究的价值。

关 键 词：肥胖症 NYGGF4基因表达  计算生物学

分 类 号：R723.14]