文献类型：期刊文章

作　　者：林毅[1] 张同武[1] 陈智山[1] 蔡福营[1]

机构地区：[1]华侨大学生物工程与技术系工业生物技术福建省高校重点实验室,福建泉州362021

出　　处：《激光生物学报》

基　　金：国家自然科学基金项目(40601046);细胞生物学与肿瘤细胞工程教育部重点实验室开放基金项目(2005103)

年　　份：2008

卷　　号：17

期　　号：2

起止页码：181-185

语　　种：中文

收录情况：AJ、CAS、CSCD、CSCD_E2011_2012、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：通过同源建模得到了抗癌晶体蛋白Parasporin-2(Cry46Aa1)活性区的初始三维结构,利用分子动力学方法对初始三维结构进行优化。为了评估模型的好坏,利用Ramachandran plot和结构匹配等方法对模型进行评价。结果显示,所得的Parasporin-2空间模型良好。比较了Cry46Aa1与Cry46Ab1这两种高度同源的抗癌晶体蛋白的空间结构,找出了其空间结构上的不同之处。通过大分子对接程序Hex4.5,模拟了Parasporin-2与受体GPI-瞄固蛋白(CD59)的相互作用。结果显示,Parasporin-2中参与对接的活性位点位于两个α-螺旋下方的凹槽内,而CD59中的四个loop倾向于插入该凹槽内。研究结果为Parasporin-2的抗癌机制研究及其理性改造奠定了基础。

关 键 词：抗癌晶体蛋白 同源建模 分子动力学模拟 大分子对接  

分 类 号：Q71]