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实时荧光PCR检测γ-干扰素对大鼠神经干细胞versican基因表达的调控
Detecting the Regulation of IFN-γ on the Expression of Versican Isoforms in Rat Neural Stem Cells by SYBR Green Real-time PCR
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]上海交通大学附属第九人民医院检验科,上海200011 [2]上海交通大学医学院神经生物学实验室,上海200025
年 份:2008
卷 号:23
期 号:2
起止页码:16-19
语 种:中文
收录情况:CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、IC、JST、ZGKJHX、普通刊
摘 要:目的建立检测硫酸软骨素蛋白多糖versican不同亚型mRNA的SYBR Green实时PCR方法,观察炎症因子γ-干扰素对大鼠神经干细胞中不同versican亚型基因表达的调控。方法分离孕大鼠胚胎的神经干细胞,在含有营养因子的基质中进行体外培养。当加入处理因素γ-干扰素并作用48h后,收集细胞,抽提RNA进行反转录。同时根据versican不同亚型的基因序列,设计特异性不同的引物,利用ABI7900PCR仪和SYBR Green,建立优化的实时荧光PCR反应条件,通过比较Ct(△△Ct)进行基因表达的相对定量分析。结果熔解曲线分析和琼脂糖凝胶电泳结果证实了PCR反应的特异性;相对定量结果显示,γ-干扰素可以上调versican V2基因的表达,但对versican V1的表达无影响。结论应用SYBR Green实时荧光PCR可以特异、准确、快速地分析versican不同亚型的基因表达差异,为系统研究其复杂的调控机制创造了有力条件。
关 键 词:SYBR Green荧光染料 实时PCR VERSICAN 神经干细胞
分 类 号:Q503] Q344.13
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