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正交设计在实时定量PCR检测条件优化中的应用
Application of orthogonal design to optimize real-time quantitative PCR conditions
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]山西医科大学法医学院法医病理学教研室,山西太原030001
基 金:山西省留学回国人员基金资助项目(200528);山西省青年科技研究基金项目(2007021047)
年 份:2008
卷 号:23
期 号:2
起止页码:111-114
语 种:中文
收录情况:CSCD、CSCD_E2011_2012、EMBASE、IC、JST、SCOPUS、ZGKJHX、普通刊
摘 要:目的探索正交设计在实时定量PCR检测条件优化中的应用,找出扩增ICAM-1基因的最佳条件。方法建立大鼠皮肤损伤模型,采用正交设计实时定量PCR的各影响条件,提取损伤处皮肤组织总RNA反转录成cDNA,cDNA作为模板,通过特异性引物扩增ICAM-1基因。对扩增曲线和融解曲线制定评分标准,量化不同实验条件下的扩增结果并进行统计分析。结果退火温度、模板量和引物浓度直接影响扩增效果,但三因素间无相互作用。结果经统计学分析表明退火温度61℃、模板cDNA用量0.4μg和引物终浓度150μmol/L为实时定量PCR检测ICAM-1基因的最佳条件组合。结论正交设计是一种切实可行、快速经济的实时定量PCR检测条件优化方法。
关 键 词:法医病理学 正交设计 实时定量PCR 皮肤损伤 ICAM-1
分 类 号:D919[法医学类]
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