期刊文章详细信息
DNA条形码识别 Ⅲ.媒介蚊类DNA条形码芯片的初步研究
DNA barcode identification Ⅲ.A primary study of DNA barcode chip on medical mosquito
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中国科学院成都生物研究所,成都610041 [2]四川出入境检验检疫局 [3]中国科学院成都计算机应用研究所
基 金:国家自然科学基金(30570250);国家质检总局科技计划项目(2006IK189)
年 份:2008
卷 号:19
期 号:2
起止页码:99-103
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2004、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:目的利用DNA条形码信息研制DNA芯片,建立快速高效的医学媒介蚊类鉴定方法。方法以蚊科5属15种,共30个样本为研究材料,获取其DNA条形码信息(COⅠ基因片段序列),采用基因块motif技术,搜索15个样本的同源保守基因序列,制作虚拟DNA条形码芯片。虚拟电子杂交30个样本,应用软件Bio-Edit计算属、种及种内个体间的同一性,应用phylip3.66软件以最大简约法分别对杂交结果和原序列进行聚类分析比较。结果选择78个DNA片段制作一张虚拟DNA条形码芯片,计算属间的平均同一性为0.75,同一属内种间的平均同一性为0.84,种内个体间的平均同一性为0.98,聚类分析结果一致。结论研制的虚拟DNA芯片能够鉴定本研究中的15种蚊虫,利用DNA条形码信息,设计DNA芯片在理论上可行。
关 键 词:CO I基因 DNA条形码 DNA芯片 蚊虫
分 类 号:R384.1]
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