期刊文章详细信息
广西不同时期IBV分离株S1基因高变区Ⅰ的遗传变异分析
Genetic Variation of S1 Gene Hypervariable Region I of Infectious Bronchitis Viruses Isolated in Different Periods in Guangxi
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]广西大学养禽与禽病研究所,广西南宁530005
基 金:国家自然科学基金(30700599);广西自然科学基金(桂科青0728003);广西区教育厅科研项目(C150002);广西大学科研项目(DD150032);硕士研究生科研创新项目(2007105930906M87)
年 份:2008
卷 号:24
期 号:2
起止页码:126-132
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2004、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:对广西1985-2007年间分离到的22株传染性支气管炎病毒(IBV)的S1基因高变区I(HVRI)进行序列测定,并与发表的其他IBV参考株及鸽子分离的冠状病毒株的基因序列进行比较和分析。系统进化关系显示毒株可分为5个基因群,其中有16个广西分离株属第1群,它们与鸽子冠状病毒分离株的氨基酸序列同源性较高,与Massachusetts(Mass)型疫苗株的同源性较低。有15个分离株在33-34位和34~35之间分别有4个和3个氨基酸残基的插入,GX-NN6在33~34位和34~35位之间则均有4个氨基酸残基的插入;GX-YL1、GX-NN2与常用的Mass型疫苗株的亲缘关系最近,同属于第Ⅱ群;GX-G、GX-XD与日本同一时期分离的毒株JP Miyazaki 89亲缘关系最近,属于第Ⅲ群;GX-YL6、GX-NN7与欧洲毒株4/91亲缘关系较近,属于第V群。结果表明广西存在着多种类型IBV毒株的流行,毒株S1基因HVRI碱基的突变或插入比较普遍,可导致其氨基酸序列的变化,绝大部分毒株与目前常用的Mass型疫苗株的亲缘关系较低。同一时期的分离株同源性较高,但无明显的地域性差异。
关 键 词:传染性支气管炎病毒 分离株 S1基因高变区I 序列测定 遗传变异 基因型
分 类 号:S852.65]
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